11月11日,中國抗癌協(xié)會腫瘤病理專業(yè)委員會分子病理協(xié)作組和腫瘤標志專業(yè)委員會遺傳性腫瘤標志物協(xié)作組聯合編撰的《腫瘤突變負荷檢測及臨床應用中國專家共識(2020年版)》在《中國癌癥防治雜志》正式發(fā)表,共識圍繞TMB的定義、臨床意義、檢測標準化及與其他免疫標志物如PD-L1、dMMR/MSI-H的關系等要點,為臨床提供8條TMB檢測及應用共識推薦,以期最大可能提高免疫檢查點抑制劑(ICIs)治療療效預測的準確性和可靠性。
1、TMB的定義
專家共識:TMB一般是指特定區(qū)域內體細胞非同義突變的個數,通常用每兆堿基有多少個突變表示(XX個突變/Mb)。TMB評估受樣本質量和數量、檢測基因組大小、生信分析方法等多種因素影響,臨床應用前應了解TMB的適用范圍。不同檢測方法獲得的TMB應進行系統(tǒng)評估,判斷是否具有可比性。TMB數值可反映腫瘤內產生腫瘤新抗原的潛力,與DNA修復缺陷密切相關,在多種腫瘤中dMMR和MSI-H患者具有較高的TMB。
2、TMB的臨床意義
2.1 組織TMB可作為免疫治療獨立的療效預測生物標志物
專家共識:組織TMB(tTMB)是一個新興的獨立ICIs治療療效預測標志物,與多種腫瘤類型ICIs單藥或兩種ICIs聯合治療的療效相關,已證實可作為泛癌種免疫治療療效的預測標志物。推薦既往標準治療后疾病進展且沒有更好替代療法的實體瘤患者,尤其是高TMB的患者進行TMB檢測,有助于擴大免疫治療獲益人群。中國人群 TMB的獨立預測價值仍需更多前瞻性研究驗證。
2.2 血液TMB與tTMB具有顯著相關性
專家共識:目前研究證據顯示在NSCLC中血液TMB(bTMB)與tTMB具有顯著相關性,但bTMB檢測無統(tǒng)一標準。多項回顧性研究發(fā)現高bTMB與NSCLC患者接受單藥ICIs治療獲益顯著相關,但尚未獲得高級別前瞻性臨床研究證實。
3、TMB檢測的標準化
3.1 樣本收集、處理原則
專家共識:推薦使用近期石蠟包埋腫瘤組織樣本進行tTMB檢測,待檢測組織應首先完成病理質控并確保惡性腫瘤細胞數能夠滿足檢測要求。為過濾胚系突變對后續(xù)tTMB評估的影響,應采集患者外周血、唾液或正常組織作為對照樣本。建議優(yōu)先采用NMPA批準上市的核酸提取試劑盒進行基因組DNA提取,tTMB檢測實驗室應根據實際需求建立合適的DNA樣品質控標準和操作流程,對待測DNA樣品純度、濃度及片段化程度進行嚴格質控。腫瘤原發(fā)灶與遠處轉移灶組織均可用于tTMB評估。
3.2 TMB檢測的Panel設計和平臺選擇
專家共識:采用靶向測序Panel進行TMB評估時,建議與WES評估的TMB進行一致性評價。靶向測序Panel覆蓋范圍原則上不應<1.0 Mb,最低有效測序深度應≥500×。建議進行TMB檢測的靶向測序Panel盡可能涵蓋患者更多的其他分子遺傳信息,包括可指導靶向治療的驅動基因突變、與基因變異產生相關的免疫治療正向預測因子以及可能的免疫治療負向預測因子。目前已有多款NGS測序儀獲國家NMPA批準用于臨床基因檢測,不同實驗室可依據樣本量、時效要求選擇不同測序平臺。
3.3 TMB算法的標準化要求
專家共識:基于靶向測序Panel的TMB檢測應以WES檢測為金標準,納入影響蛋白質編碼的體細胞突變,應保證檢出突變頻率≥5%的體細胞突變,以保證TMB檢測值的準確性和穩(wěn)定性;應依托ICIs療效隨訪數據庫對基因組比對和突變檢出算法開展標準化研究;Panel檢測區(qū)域可影響TMB值,應通過至少1 000例WES數據予以校正。同時建議使用對照樣本過濾胚系變異。
3.4 TMB閾值的探索與臨床應用
專家共識:TMB值在不同癌種中存在顯著差異,應依據ICIs臨床療效確定閾值,才能最大可能篩選出ICIs治療的潛在獲益人群。值得注意的是,不同靶向測序Panel的TMB檢測體系之間TMB閾值不能通用。
3.5 TMB報告模板的初步建議
專家共識:TMB報告內容除重點描述TMB計算原則和數值外,還應針對癌種的免疫治療意義進行解讀;同時還需系統(tǒng)評估Panel檢測的各種驅動基因突變情況,以全面解患者的腫瘤生物學特征,建議應用分子腫瘤診治專家組模式(MTB)進行臨床輔助決策。
4、TMB聯合應用展望
作為一個新興的ICIs治療療效預測標志物,TMB在臨床應用中還處于初始階段,檢測技術還在不斷完善,臨床意義也在不斷豐富。最近有研究發(fā)現,TMB與其他腫瘤免疫治療相關標志物(如PD-L1、MSI)聯合應用,或能提高免疫治療療效預測的準確性和精確性,但具體的聯合策略還需要進一步探索。
參考資料:
中國抗癌協(xié)會腫瘤標志專業(yè)委員會遺傳性腫瘤標志物協(xié)作組, 中國抗癌協(xié)會腫瘤病理專業(yè)委員會分子病理協(xié)作組. 腫瘤突變負荷檢測及臨床應用中國專家共識(2020年版)[J]. 中國癌癥防治雜志, 2020, 12(5): 485-494.